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Ⅲ-03-01
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帕米尔－喀喇昆仑山高寒荒漠草原生态亚区
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该亚区位于新疆的最西部，塔里木盆地西部的东帕米尔高原和喀喇昆仑山地，西与塔吉克斯坦、阿富汗、巴基斯坦等国接壤
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Ⅲ-03-02
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阿尔金山荒漠生态亚区
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该亚区位于该亚区主体为阿尔金山地，西接东昆仑，北部为塔里木盆地，南部为柴达木盆地，东接祁连山脉
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Ⅲ-03-03
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昆仑山东段高寒荒漠草原生态亚区
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该亚区位于阿尔金山西段南部，延伸至青海的柴达木盆地南缘的昆仑山地
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Ⅲ-03-04
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昆仑山中段高寒荒漠草原生态亚区
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该亚区位于昆仑山脉中段
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Ⅲ-03-05
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昆仑山西段高寒荒漠草原生态亚区
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该亚区位于昆仑山脉西段
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