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Ⅱ-08-03-01
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阿克苏河冲积平原荒漠、绿洲农业生态功能区
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阿克苏市、温宿县、阿瓦提县、柯坪县
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Ⅱ-08-03-02
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渭干河三角洲荒漠、绿洲农业盐渍化敏感生态功能区
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库车县、沙雅县、新和县
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Ⅱ-08-03-03
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库尔勒一轮台城镇和石油基地建设生态功能区
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库尔勒市、轮台县、尉犁县
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Ⅱ-08-03-04
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喀什三角洲荒漠—绿洲农业、盐渍化敏感与改水防病生态功能区
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喀什市、阿图什市、疏勒县、疏附县、伽师县、乌恰县、阿克陶县、岳普湖县、英吉沙县、莎车县、麦盖提县、巴楚县
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Ⅱ-08-03-05
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塔里木河上中游乔灌草及胡杨林保护生态功能区
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阿克苏市、沙雅县、库车县、轮台县、库尔勒市、尉犁县
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Ⅱ-08-03-06
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孔雀河下游生态恢复及人文景观保护生态功能区
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尉犁县、若羌县
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Ⅱ-08-03-07
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叶尔羌河平原荒漠、绿洲农业及荒漠河岸林保护生态功能
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叶城县、泽普县、莎车县、麦盖提县、巴楚县、柯坪县、阿瓦提县
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Ⅱ-08-03-08
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塔里木河下游绿色走廊植被恢复生态功能区
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尉犁县、若羌县
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